bioRxiv : the preprint server for biology. 2025 Jun 4:2025.06.02.657512. doi: 10.1101/2025.06.02.657512
Single-nucleus epigenomic dysregulation unmasks genetic risk-associated neurodegenerative glia states
单核表观基因组紊乱揭示了遗传风险相关的神经退行性胶质细胞状态 翻译改进
Xia Han, Tao Zhang, Chia-Yi Lee, Ashvin Ravi, Salvatore Spina, Alissa Nana Li, Lea T Grinberg, William W Seeley, Laura M Huckins, Towfique Raj, Kristen J Brennand, Jessica E Rexach
作者单位 +展开
作者单位
DOI: 10.1101/2025.06.02.657512 PMID: 40502140
摘要 中英对照阅读
异常tau蛋白的积累在与tau相关的痴呆症（如阿尔茨海默病 (AD)、皮克病 (PiD) 和进行性核上性麻痹 (PSP)）中选择性地影响不同的脑区域和特定类型的神经元及胶质细胞。尽管这三种疾病都具有tau蛋白病理学的特征，但与风险相关的细胞状态下的非编码遗传变异调控回路仍有待阐明。通过AD、PiD 和 PSP 中六个细胞类型和五十个亚类的染色质可访问性和基因表达的配对单核分析，我们定义了细胞特异性的顺式调节元件（CRE）。比较三种疾病动态中的 CRE，我们发现胶质细胞在与应激相关的动态细胞反应中表现出特定疾病的基因调控。我们证明，影响小胶质细胞基因调控的人类遗传变异会集中到不同的且协同调控的模块中，这些模块影响特定的细胞功能。此外，在特定疾病状态下的胶质细胞中，多基因风险修饰因子的最大共访问性修改了特定通路，例如 PiD 中鞘氨醇肌醇调节。我们的研究为与初级tauopathy相关的多基因修饰因子有关的胶质调控提供了信息，并引入了可调用以增强治疗考虑的路径。
相关内容
-
The potential role of epigenomic dysregulation in complex human disease
表观基因组调控失常在复杂人类疾病中的潜在作用
Eli Hatchwell
Trends in genetics : TIG. 2007 Nov;23(11):588-95.
-
Perturbation of 3D nuclear architecture, epigenomic dysregulation and aging, and cannabinoid synaptopathy reconfigures conceptualization of cannabinoid pathophysiology: part 1-aging and epigenomics
三维核结构的扰动、表观基因组失调与衰老以及大麻素神经病理：第一部分——衰老和表观基因组学
Albert Stuart Reece
Frontiers in psychiatry. 2023 Sep 5:14:1182535.
-
Experimental approaches to the study of epigenomic dysregulation in ageing
表观基因组紊乱在衰老中的实验研究方法
Reid F Thompson
Experimental gerontology. 2010 Apr;45(4):255-68.
-
Single-nucleus sequencing reveals enriched expression of genetic risk factors in extratelencephalic neurons sensitive to degeneration in ALS
单核测序揭示了ALS中易退行的extratelencephalic神经元存在丰富的遗传风险因子表达
Francesco Limone et al.
Nature aging. 2024 Jul;4(7):984-997.
-
Extensive epigenomic dysregulation is a hallmark of homologous recombination deficiency in triple-negative breast cancer
三阴性乳腺癌中同源重组缺陷的表观基因组失调特征
Youdinghuan Chen et al.
International journal of cancer. 2024 Dec 5.
-
Epigenomic Dysregulation in Schizophrenia: In Search of Disease Etiology and Biomarkers
精神分裂症中的表观遗传调控紊乱：探究疾病成因和生物标志物
Behnaz Khavari
Cells. 2020 Aug 5;9(8):1837.
-
Alpha-synuclein overexpression induces epigenomic dysregulation of glutamate signaling and locomotor pathways
α-突触核蛋白过度表达诱导谷氨酸信号和运动通路表观基因组失调
Samantha L Schaffner et al.
Human molecular genetics. 2022 Oct 28;31(21):3694-3714.
-
Epigenomic dysregulation correlates with arachnoid cyst formation and neurodevelopmental symptoms
表观基因组失调与蛛网膜囊肿形成和神经发育症状相关
Adam J. Kundishora
Nature medicine. 2023 Mar;29(3):541-542.
-
The Einstein Center for Epigenomics: studying the role of epigenomic dysregulation in human disease
Einstein表观基因组中心：研究表观基因组异常在人类疾病中的作用
Andrew S McLellan et al.
Epigenomics. 2009 Oct;1(1):33-8.