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Sleep advances : a journal of the Sleep Research Society. 2025 May 20;6(2):zpaf032. doi: 10.1093/sleepadvances/zpaf032 0.02025

SleepInvestigatoR: a flexible R function for analyzing scored sleep in rodents

睡眠调查员：一个灵活的R函数用于分析啮齿动物的睡眠评分 翻译改进

Mackenzie C Gamble  1, Benjamin R Williams  2, James T McKenna  3, Ryan W Logan  2  4

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作者单位

  • 1 Molecular and Translational Medicine, Department of Medicine, Boston University School of Medicine, Boston, MA, USA.
  • 2 Department of Psychiatry, University of Massachusetts Chan Medical School, Worcester, MA, USA.
  • 3 VA Boston Healthcare System and Department of Psychiatry, Harvard Medical School, West Roxbury, MA, USA.
  • 4 Department of Neurobiology, University of Massachusetts Chan Medical School, Worcester, MA, USA.

    • DOI: 10.1093/sleepadvances/zpaf032 PMID: 40491986

    摘要 中英对照阅读

    Analyzing scored sleep is a fundamental prerequisite to understanding how sleep changes between health and disease. Classically, this is accomplished by manually calculating various measures (e.g. percent of non-rapid eye movement sleep) from a collection of scored sleep files. This process can be tedious and error-prone, especially when studies include large animal numbers or involve long recording sessions. To address this issue, we present SleepInvestig... ...点击完成人机验证后继续浏览

    分析评分睡眠是理解健康与疾病状态下睡眠变化的基本前提。传统上，这通过手动计算各种指标（例如非快速眼动睡眠的百分比）从一组评分睡眠文件中得出。这一过程可能会很繁琐且容易出错，特别是在研究涉及大量动物或长时间记录的情况下。为解决这个问题，我们推出了SleepInvestigatoR，这是一个灵活的工具，可以将多个评分睡眠文件快速整理并分析成单一输出结果。该功能用开源统计语言R编写，并具有总共25个参数，可根据各种实验需求进行设置。SleepInvestigatoR提供了总计23种独特的睡眠指标，包括所有在啮齿动物文献中常见的指标。还提供了一个简单的绘图函数，可以快速绘制和可视化评分数据。所有代码均设计为需要很少的正式编程知识即可实施，并且在对应的GitHub页面上提供了逐步操作说明。总体而言，SleepInvestigatoR为睡眠研究人员提供了一种关键工具，可提高分析评分啮齿动物睡眠时的效率、解释能力和再现性。

    关键词：R；昼夜节律；开源代码；睡眠结构。

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    期刊名：Sleep advances

    缩写：

    ISSN：2632-5012

    e-ISSN：

    IF/分区：0.0/

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