首页 文献索引 SCI期刊 AI助手
首页 正文

Comparative Study The plant genome. 2025 Jun;18(2):e70037. doi: 10.1002/tpg2.70037 Q13.82025

Genome-wide locus-allele comparison reveals differential evolution dynamics from annual wild to landrace and released cultivar soybeans

全基因组位点-等位基因对比揭示了从年野生大豆到栽培大豆的不同进化动态 翻译改进

Xinyang Hu  1, Jianbo He  1, Junyi Gai  1

作者单位 +展开

作者单位

  • 1 Soybean Research Institute, Zhongshan Biological Breeding Laboratory (ZSBBL), MARA National Center for Soybean Improvement & MARA Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Soybean, State Innovation Platform for Integrated Production and Education in Soybean Bio-Breeding, National Key Laboratory for Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China.

    • DOI: 10.1002/tpg2.70037 PMID: 40369723

    摘要 中英对照阅读

    Previous studies on population evolution relied primarily on allele frequency analysis using molecular markers or genome sequence segments, like selective sweeps. With the sequencing technique developed, we suggest the genome-wide locus-allele comparison to detect the genomic structure variation among populations. Its key point lies in taking SNP linkage disequilibrium block as uniform genomic marker for genome-wide gene and inter-gene regions to meet the ... ...点击完成人机验证后继续浏览

    以往关于群体进化的研究主要依赖于使用分子标记或基因组序列片段进行等位基因频率分析，如选择性扫荡。随着测序技术的发展，我们建议采用全基因组位点-等位基因比较来检测不同群体之间的基因组结构变异。其关键在于将单核苷酸多态性连锁不平衡块作为统一的基因组标记应用于全基因组基因和非编码区，以满足自然种群中多个等位基因的需求。我们分析了来自中国南部、北部和东北部生态区域（SC, NC 和 NEC）的750个野生年份大豆存取样本（WAs）、地方品种（LRs）以及已发布的栽培品种（RCs），探讨了它们在四个进化过程中的动态变化：WA→LR→RC，WASC→WANC→WANEC，LRSC→LRNC→LRNEC以及 LRSC→RCSC/LRNC→RCNC/LRNEC→RCNEC。我们的主要发现是，在驯化和现代育种阶段，祖先群体与其后代群体之间/之间的等位基因和位点零一变化涉及整个群体的大量部分，分别为25.10% 和 18.62%，而这些变化并未被选择性扫荡所检测到。群体进化的本质是基于普通等位基因频率变化基础上的等位基因零一变化，进而导致位点零一变化。当其频率在前一代为0.0-0.3和0.8-0.99时，等位基因/位点零一变异更为频繁发生。由于自然选择与人工选择压力下等位基因/位点零一变化的组合不同，WA 和 LR 的地理进化是不同的过程。相比于每年的等位基因排除率，在驯化和现代育种阶段，每年的新等位基因出现速率相对稳定（2.75E-5 对比 1.34E-5，以及 1.42E-3对比 1.10E-5），分别。

    © 2025 The Author(s). The Plant Genome published by Wiley Periodicals LLC on behalf of Crop Science Society of America.

    翻译效果不满意？ 用Ai改进或 寻求AI助手帮助 ，对摘要进行重点提炼
    Copyright © The plant genome. 中文内容为AI机器翻译，仅供参考！

    相关内容

    期刊名：Plant genome

    缩写：PLANT GENOME-US

    ISSN：N/A

    e-ISSN：1940-3372

    IF/分区：3.8/Q1

    文章目录 更多期刊信息

    全文链接
    官方链接
    PMC全文
    引文链接
    复制
    已复制！
    推荐内容
    Genome-wide locus-allele comparison reveals differential evolution dynamics from annual wild to landrace and released cultivar soybeans